名侦探柯南服部平次在48集取证过程中与柯南撞在一起，就起了疑心，在57、58集时又因取证撞到柯南而更加怀疑，在柯南用麻醉针让他睡着前看到他用领结形变声器，怀疑得到证实，并威胁柯南要告诉小兰，他就是新一，柯南只好把事情的真相告诉他。

平次发现柯南是新一，也是通过一个事件来的。至于这个事件在这里就不细说了，反正在侦查这个案件的时候。因为侦探的直觉，柯南和平次都顺着一个方向调查。这也使得两位的头撞在了一起。就是这一撞，仿佛是两人的脑电波发生了什么奇妙的事情。平次初步对柯南的身份有了怀疑。柯南的身份就因为这一撞，被平次给怀疑了。

而接下来，平次有找到小兰。进一步来印证自己的判断。将柯南一只手就给拎了起来。话说柯南真轻啊。我记得柯南好像就有18千克多一点的体重，不过平次能单手拎起柯南，说明平次的力量也不一般。平次就这样问了小兰，小五郎推理的时候，柯南的都在什么地方。而小兰的答案进一步印证了平次的怀疑。因为小兰说柯南每次都是在小五郎身后，而每次小五郎都是在沉睡状态。

在接下来，在推理案件的时候，柯南不经意间将推理说的头头是道。引起了众人的留意，虽然柯南及时发觉，并马上扮演自己是小孩子的角色。但还是被仔细观察他平次给发现了。看到柯南的推理，平次的脑中之闪现过一个人，那就是工藤新一。

最后决定性的被平次发现柯南就是新一，是在两人都了解了事件的真相。平次由于对柯南有怀疑，所以并不急着做出推理。但柯南着急了啊，假借着上厕所的借口，将平次射晕了。利用平次的口说出事件的经过。

但是柯南没有想到的是，平次中途就清醒过来了。而柯南的推理，和柯南使用变声器，都被平次发现了。但是就是这样，我们的柯南还是没有承认自己就是新一。倒是当平次要把这个发现告诉小兰的时候，我们的柯南终于怂了。承认了自己就是新一的事实。

可以说平次能发现柯南就是新一，是因为侦探和侦探之间的某种默契，也就是两人身上散发着同一种的气息。正所谓气味相投，所以两人虽然没有太多的接触，但碰上了就会被彼此吸引。