小兰并没有发现柯南身份。小兰只是已经对柯南有所怀疑。

而最早出现怀疑是在007集“每月一件礼物胁迫事件”中，一位姓小川的先生来到毛利侦探事务所寻求毛利小五郎的帮助，他表示大约从两年前开始，每个月都会有人寄钱和玩具给他，但是寄件人的身份和地址都是假的；小川先生有一个5岁的儿子，名字叫永太，永太因为每个月都会收到玩具所以很开心，但小川先生却总觉得不太对劲，所以把钱都收起来一点没有动。

每个月寄的钱都是100万日元（按现在的汇率大约60000元人民币），算上这个月一共2500万日元，而且以前每个月都会用个大包装把玩具和钱装在一起，但是这次只用了一个信封，里面还带了一封信。信上的意思大概是说用这2500万日元换小川先生的什么东西。

但是在翻看小川先生收到的礼物时，柯南发现游戏机的成绩记录上的名字是荻野智也，而小川先生儿子的名字应该是永太；柯南忽然想到刚才翻看病案时好像看到过这个名字，于是赶紧查看病历，终于发现了关联。荻野智也，男，3年前因病入院，当时5岁，接受小川先生的手术后就死了，当时的日期就是2月19号；柯南联想到小川先生最后收到的信件，两者结合在一起后，他终于把所有谜题解开了！那些礼物是死去的荻野智也的遗物！那束牵牛花就是荻野智也忌日的时候供奉的花！而更可怕的是，那收到的2500万日元要和小川先生交换的就是他儿子永太的性命。当小川医生打电话去儿子幼儿园的时候却发现儿子已经被绑架了。虽然最后永太并没有危险。

但是另一方面，由于柯南的表现过于突出，引起了毛利兰的怀疑，她开始怀疑柯南的真实身份到底是谁？柯南仅通过小川先生双手食指的凹痕就推断出他是一名外科医生；小兰回想到在工藤新一失踪的当天，新一仅通过握手就能知道对方是名体操运动员，这也更加坚定了小兰的怀疑；柯南又通过指出小川先生收到的礼物包装盒上没有条形码和玩具上有划痕来引导毛利小五郎的查案方向，再一次引起了小兰的注意。小兰想到董事长千金绑架事件、偶像密室杀人事件中都是由于柯南的关键提醒，案件才得以破获，而且工藤新一消失的那天也就是柯南出现的那天，这也太巧合了吧？于是，小兰决定试探试探柯南，趁其不备冲着柯南叫出了工藤新一的名字，柯南很自然的就答应了，答应完以后两人全都惊呆了；柯南心想绝不能让小兰知道这件事，否则大家都有危险，所以就装成小孩子开始打电动，想借机打消小兰的疑虑。

最后，在侦探事务所的家中，小兰趁着柯南不注意的时候告诉他体育老师要结婚了，柯南顺嘴答应了一句“你说的那个大猩猩老师啊？”这下子小兰更加确信柯南就是新一了，否则柯南怎么会知道自己高中体育老师呢？就在小兰逼迫柯南承认身份的时候，电话响了，竟然是新一打来的，这才推翻了小兰的猜测，柯南也逃过一劫，否则身份暴露的话，后面还要怎么办！

而在小兰逼迫柯南承认身份的时候，“新一”打来了电话，这才推翻了之前对柯南的猜测，柯南也就此逃过一劫。故事的最后才知道，是阿笠博士用变声器给小兰打的电话，这才瞒过去。