祁连山不在玉门关外，而在玉门关内。

玉门关的遗址位于甘肃的西端，河西走廊的最西端，距离敦煌市比较近，只有90公里，而祁连山主要位于甘肃省的西部边境和青海省的东北部，其最西端是当金山口，位置在玉门关以东，并且祁连山脉东边的城市是天祝，西边是甘州，而甘州也位于玉门关以东，所以祁连山在玉门关之内。

祁连山位于中国青海省东北部与甘肃省西部边境，是中国境内主要山脉之一，由多条西北-东南走向的平行山脉和宽谷组成，东西长800公里，南北宽200~400公里，海拔4000~6000米，共有冰川3306条，面积约2062平方公里。

祁连山西端在当金山口与阿尔金山脉相接。东端至黄河谷地，与秦岭、六盘山相连。长近1000千米。属褶皱断块山。最宽处在酒泉市与柴达木盆地之间，达300千米。山脉自西北至东南走向，包括大雪山、托来山、托来南山、野马南山、疏勒南山、党河南山、土尔根达坂山、柴达木山和宗务隆山。山峰多海拔4000~5500米，最高峰疏勒南山的团结峰海拔5808米。海拔4000米以上的山峰终年积雪，山间谷地也在海拔3000~3500米之间。

祁连山素有万宝山之称，蕴藏着种类繁多、品质优良的矿藏，有石棉矿，黄铁矿、铬铁矿及铜、铅、锌等多种矿产，八宝山的石棉为国内稀有的湿纺原料。祁连山区冷湿气候，有利于牧草生长，在海拔2800米以上的地带，分布有大片草原、为发展牧业提供了良好场所。