水蕨菜和山蕨菜的区别主要体现在种属、形状、生长发育地位以及食用方法等方面。

1、种属不同：虽然它们两者都被称为“蕨菜”，但却是两个不同的种属。山蕨菜为水龙骨科的多年生长木本植物；而水蕨菜为水蕨科的一年生水生物木本植物。

2、形状不同：山蕨菜的叶缘向内打卷，叶茎鲜嫩时有细微的茸毛，草质化后茎杆光洁，茸毛也会慢慢消退；而水蕨菜地下茎短而站立，没有毛，叶子通常站立或者悬浮在河面上。

3、生长地点不同：山蕨菜生长在树林之中，而水蕨菜则生长在江河溪流边等水资源比较丰富的地方。

4、食用方法不同：山蕨菜通常有苦味，要用开水烫一下，再用冷水浸泡之后才可以食用；而水蕨菜比较细嫩且汁多，清洗之后就可以立即食用。

水蕨菜为蕨类水蕨科植物水蕨的嫩叶，沸水焯后，清水浸泡，多用于热菜。1年生草本，高30至80厘米，为绿色。羽裂，能育叶较大，矩圆形或卵状三角形长15至40厘米，宽10至22厘米，2至3回状分裂。

山蕨菜是中国东北地区特产的野生植物。山蕨菜为水龙骨科多年生草本。地下根茎黑褐色，长而横向伸展，直径0.6至0.8厘米，长10余厘米，最长可以达到30厘米。主要分布在广西、云南、广东、辽宁省、湖南省、江西省等、黑龙江大兴安岭、四川省等。